1、外形和口感不同。甜蕎麥的顆粒呈現三棱”角狀非常明顯，吃起來沒有苦味；苦蕎麥的顆粒呈現三棱”圓潤狀，吃起來略帶苦苦的味道。
2、營養不同。苦蕎所含的生物類黃酮如蘆丁（維生素P）和煙酸（維生素PP）爲甜蕎的13、5倍，而燕麥、小麥、大米等禾本科植物不含維生素P，膳食纖維、蛋白質、維生素B2分別爲甜蕎的1、6倍、1、65倍、3、16倍。
3、功效不同。苦蕎麥茶含蘆丁，可軟化血管，具有降血脂、降血糖、降血壓，減肥敗毒、清理人體垃圾、激活胰島素分泌等功效，苦蕎麥茶富含蛋白質礦物元素和人體必須的9種脂肪酸、亞油酸等生物活性物質，可健脾開胃、通便潤腸、美容養顏、醒腦提神、防失眠、抗衰老、抗氧化、平衡人體機能，具有神奇的養肝、護肝和解酒功能；甜蕎麥的莖葉有降壓，止血的功效，適用於高血壓，毛細血管脆弱性出血，防止中風，視網膜出血，肺出血。甜蕎麥的種子有健胃，收斂的功效，用於止虛汗。可以炒香研末，外用收斂止汗，消炎。
4、用途不同。苦蕎麥和甜蕎麥可以作爲食物使用，例如人們熟悉的蕎麥茶，做蕎麥茶無疑是大多做成苦蕎茶的五穀之王”苦蕎麥更好；蕎麥殼可以用來做枕頭，做枕頭的話苦蕎麥和甜蕎麥兩者的含量相差不多，都是很高的了，已經超出正常使用需求，但苦蕎的透氣性要差好多，也硬好多，稍帶味道不如甜蕎，這也是苦蕎麥殼要比甜蕎便宜好多的原因。
5、適用人羣不同。苦蕎麥是老弱婦孺皆宜的飲食。由於苦蕎麥含有豐富的維生素E和可溶性膳食纖維，同時還含有煙酸和蘆丁（芸香甙），蘆丁有降低人體血脂和膽固醇、軟化血管、保護視力和預防腦血管出血的作用，所以對於糖尿病人更爲適宜，特別適宜食慾不振、飲食不香、腸胃積滯、慢性泄瀉、出黃汗之人和夏季痧症者食用；甜蕎麥的莖葉有降壓，止血的功效，適用於高血壓，毛細血管脆弱性出血，防止中風，視網膜出血，肺出血，此類病患者可以多食用。
