酵母應在低溫、缺氧和缺水的條件下保藏，以降低其新陳代謝作用，減少不必要的生長，防止酵母的退化、變異、死亡。
啤酒廠生產現場保藏酵母菌的方法有：
1、漢生罐保藏法：目前多數啤酒採用這種方法。純種酵母擴大培養至漢生罐後，分割大部分進行擴大培養，剩餘酵母再添加滅菌麥汁，10攝氏度至12攝氏度通風培養，達到高泡期後，冷卻至2攝氏度至4攝氏度酵母作爲保存酵母用。此保藏的酵母應定期檢查，並每月更換新麥汁。漢生罐保藏法實用易行，主要優點在於能節約時間，減少了實驗室階段複雜的分離培養工作，菌種保藏方便，可隨時進行擴大培養，將酵母長期馴養在現場麥汁中，對保持發酵質量和口味一致性較有利，若發現保藏酵母有衰退和變異現象，或污染雜菌時，應棄之不用，另外培養酵母。
2、酵母泥的保藏：傳統方法將洗淨過篩的酵母泥浸泡在0.5攝氏度至2攝氏度的無菌水中，每天換水2次至3次，最多保存2天至3天。現代啤酒廠對增設酵母泥回收罐，罐內備有攪拌器和夾套冷卻設施，回收酵母后冷卻至4攝氏度，不洗滌，1天至2天內使用，或貯藏大量泥狀酵母，保藏期可達2周以上。
3、壓榨酵母保藏法 ：將酵母泥洗滌、壓榨去水，破碎成小塊，置於淺盤，於低溫保藏。壓榨時必須保持低溫和無菌，壓榨酵母使用時，先調成泥狀再加入麥汁中。此法容易污染，一般已很少採用，酵母泥遠距離運輸可用此法。
