1、生長習性的不同，蘑菇在全球各地都廣泛的分佈，其中在熱帶、溼潤地區分佈比較多；而香菇主要是冬春季生於闊葉樹倒木上，羣生，散生或單生。2、營養價值的不同，蘑菇的營養比較豐富，高蛋白、低脂肪，含有豐富的人體必需氨基酸、礦物質、維生素和多糖等營養成分；而香菇含有多糖、多種氨基酸和多種維生素。3、毒性的不同，在自然界中有部分蘑菇是有毒的，而香菇則沒有毒。4、養分的來源不同，蘑菇的養分來源主要是豬糞、牛糞以及磷肥等各類物質；而香菇的養分主要是來自木屑中的纖維、半纖維素和木質素。
