一般有兩種方法：1、曬乾貯存：將奶豆腐置於陽光下晾曬，脫水後，黴菌、細菌就很難生長了，可以存放一到兩個星期左右；2、冷凍貯存：短時間保存可直接將奶豆腐置於冰箱中，而把奶豆腐曬乾後放在冰箱冷凍，低溫細菌就很難滋生，可以長時間保存。奶豆腐不適宜放置過久，尤其是南方的夏天，應該就奶豆腐放在冰箱中冷凍。爲了不影響奶豆腐的風味，最好在2個星期內食用。保存奶豆腐，溫度不宜過高或過低，溫度過高變餿是必然的，而溫度過低奶豆腐結塊，這樣可能是會影響其口感。
