自制酸奶可以在冰箱裏放3-5天。酸奶最好趁新鮮及時飲用，冷藏條件下可以儲存3-5天。一般來說不超過三天，酸奶的營養價值會隨着乳酸菌的減少而逐漸降低。
影響自制酸奶的保存期的要素：
1、冷凍的溫度：溫度對保存期會出現一定的影響，冬天室內溫度與電冰箱中比較適合儲存自制酸奶。不冷凍酸牛奶中的活性乳酸菌會大大減少，變成無活菌的酸鹼性乳製品，乳製品的營養成分隨着減少。並且在其中的一些危害的病菌也會剛開始繁育，進而導致酸牛奶的品質受到影響。可是，冷凍的溫度並不是說越低越好。一般酸牛奶建議的存儲溫度是4-10℃，最少不必低過4℃，過低對怕涼的人有影響。並且，一些電冰箱溫度控制不穩，會造成結凍，解除凍結後便會造成乳清溶解的狀況，儘管喝過不容易影響身心健康，但看起來很像黴變的酸牛奶，會影響胃口。
2、何時放糖：自制酸奶時，發醇好啦以後放糖，會增加酸奶發酵的時間。原汁原味的酸牛奶儲藏時間較長，若發醇以前放糖的酸牛奶，最好是當日吃了，要不然非常容易黴變；而以後放糖的酸牛奶則能夠多儲存幾日哦。因此，假如想增加自制酸奶的保存期，建議在發醇後再放糖。
