事業單位合同工不是很穩定，合同工是通過人事部門，或者人事部門自行發佈招聘信息，通過面試流程後，與用人部門簽訂勞動合同，建立的是勞動關係，與事業單位考試和部隊軍官轉業安置等方式獲取的編制有較大區別，相當於臨時工。目前事業單位的編制一般分3類。一類是正式事業編制，由當地人事局和人事主管部門下派名額負責招聘並管理的人員。第二類是人事代理編制，由當地人事主管部門下派名額招聘的人員，單被招聘人員只佔用名額，此名額不與個人檔案綁定，離開工作單位以後，編制身份自動取消。第三類就是合同編制，是由各單位招聘的勞務人員。在事業單位做合同工基本沒辦法轉正，與臨時工性質類似。所以說，事業單位合同工的工作穩定性一般。
