物質循環在生態系統之間進行，生態系統的物質循環是指無機化合物和單質通過生態系統的循環運動。生態系統中的物質循環可以用庫和流通兩個概念來加以概括。
物質循環生態系統中的物質循環，在自然狀態下，一般處於穩定的平衡狀態。也就是說，對於某一種物質，在各主要庫中的輸入和輸出量基本相等。大多數氣體型循環物質如碳、氧和氮的循環，由於有很大的大氣蓄庫，它們對於短暫的變化能夠進行迅速的自我調節。
物質循環速率物質循環的速率在空間和時間上是有很大的變化，影響物質循環速率最重要的因素有：
1、循環元素的性質：即循環速率由循環元素的化學特性和被生物有機體利用的方式不同所致；
2、生物的生長速率：這一因素影響着生物對物質的吸收速度和物質在食物鏈中的運動速度；
3、有機物分解的速率：適宜的環境有利於分解者的生存，並使有機體很快分解，迅速將生物體內的物質釋放出來，重新進入循環。
