公寓房和已購公房的區別就在於產權歸屬不同，所繳納的稅費也是不同的，公房一般都是單位或企業分配給職工的住房，在房改以後買個人產權的就是已購公房，是可以直接上市交易的，沒有購買產權的則擁有使用權，是不能直接上市交易的，公房一般都是小戶型比較多，而且物業管理的費用比較低，房齡老，採光好，房屋使用面積大。公寓房就是具有經營資格的房地產開發公司，通過出讓方式取得土地使用權之後，建設經營的住宅是按照市場價進行出售的，一般物業管理費會比較高，樓齡是新的，公攤面積比較多，大戶型比較多一點，和公房相比，使用面積相對小。此外二者的稅費收的是不一樣的，但是契稅都是一樣的，公房滿兩年就沒有增值稅，公房絕大部分是查不到原值的的，所以個稅是1%徵收，而公寓房是收差額20%，而且公寓房如果不滿兩年是有按全額的5.6%繳納增值稅，滿兩年的普通住宅則免收，滿兩年的非普通住宅則按差額的5.6%進行徵收。
