商品房和已購公房的區別主要有三個方面，首先從定義上來看，商品房是指在市場經濟條件下通過出讓的方式，從而取得了土地的使用權，然後開發建設的以市場價出售的房屋，在市場上商品房是允許上市交易的，其中包含新建的商品房以及二手房和存量房等，這些都是通過買賣雙方進行交易的，已購公房是指的是單位職工按成本價，標準價或者優惠價購買的原產權屬於單位的公共住房，也就是說已購公房是屬於某個單位的，然後是以成本、優惠價等優惠政策提供給自己的單位職工，這種產權是屬於單位的。從產權上來看，商品房的產權是歸購房者所有的而已，已購公房是屬於某個單位所有的。從上市交易上來看，已購公房的原產權是單位，如果沒有特殊約定，是不可以自由轉讓的，然後在交易的時候還需要繳納土地出讓金等費用，但是商品房是可以進行自由交易的，是不需要額外繳納土地出讓金的。
