1、兵部只處理國家軍隊的日常事務，軍隊費用的調撥，人員的安置，兵員的徵召等，也處理一些戰爭計劃的制定；樞密院是軍隊的最高指揮機構，軍隊的調防，戰爭的動員，戰爭的指揮等都是樞密院的職責，同時也領導兵部的工作；
2、兵籍司掌士兵徵募、撫卹、遷補、退役等人事；樞密院侍衛司掌侍衛事務；
3、兵部下有三衙：殿前都指揮使司、侍衛親軍馬軍都指揮使司、侍衛親軍步軍都指揮使司；凡軍國戰和攻守之策，由皇帝和政事堂共同決策，樞密院會提供建議供參考，最終方案也由樞密院提出，讓皇帝選擇採納；
4、兵部庫部司掌軍資料賬，還要研發軍用器械；樞密院職方館掌管地圖測繪、軍機檔案和情報收集；
5、兵部職方司掌國內地圖測繪和國內情報機構，烽火和城隍要寨等修築，測繪的要上報職方館；樞密院檢閱司掌督察三衙訓練，發佈演習命令等。
