個稅彙算清繳出現補繳的原因：1、在兩個以上單位任職受僱並領取工資薪金，預繳稅款時重複扣除了基本減除費用(5000元/月)；2、除工資薪金外，還有勞務報酬、稿酬、特許權使用費，各項綜合所得的收入加總後，導致適用綜合所得年稅率高於預扣率；3、預扣預繳時扣除了不該扣除的項目，或者扣除金額超過規定標準，年度合併計稅時因調減扣除額導致應納稅所得額增加；4、納稅人取得綜合所得，因扣繳義務人未依法申報收入並預扣預繳稅款，需補充申報收入等。
