農民工討要工資可以通過和用人單位協商解決，當事人在自願的基礎上進行協商，達成協議。
如果某一方不願意協商或者達不成協議的，雙方可申請企業調解委員會調解，對調解達成的協議自覺履行。
調解不成的可以依法申請仲裁。當事人也可以直接申請仲裁。
勞動者在權益受到用人單位或非法職業中介機構等侵害時也可以向勞動保障監察機構投訴。
勞動者對勞動保障行政部門作出的具體行政行爲不服的，可以申請行政複議。
【法律依據】
《關於確立勞動關係有關事項的通知》第四條，建築施工、礦山企業等用人單位將工程(業務)或經營權發包給不具備用工主體資格的組織或自然人，對該組織或自然人招用的勞動者，由具備用工主體資格的發包方承擔用工主體責任。
