石菖蒲與菖蒲的區別包括以下三點：
1、石菖蒲屬天南星科、菖蒲屬禾草狀多年生草本植物。菖蒲是一種植物。菖蒲也叫做白菖蒲、藏菖蒲，多年生草木，根狀莖粗壯。葉基生，劍形，中脈明顯突出，基部葉鞘套折，有膜質邊緣。生於沼澤地、溪流或水田邊。
2、石菖蒲屬於一類中草藥，菖蒲沒有入藥的作用。
3、石菖蒲屬於菖蒲的一種，因此相較於菖蒲，種類較少。
菖蒲的作用：
菖蒲是中國傳統文化中可防疫驅邪的靈草，端午節有把菖蒲葉和艾葉捆一起插於檐下的習俗；菖蒲是園林綠化中，常用的水生植物，其豐富的品種，較高的觀賞價值，在園林綠化中，得以充分應用。菖蒲葉叢翠綠，端莊秀麗，具有香氣，適宜水景岸邊及水體綠化，也可盆栽觀賞或作佈景用，葉、花序還可以作插花材料，園林上叢植於湖，塘岸邊，或點綴於庭園水景和臨水假山一隅，有良好的觀賞價值；古人夜讀，常在油燈下放置一盆菖蒲，原因就是菖蒲具有吸附空氣中微塵的功能，可免燈煙燻眼之苦；菖蒲可作香料；菖蒲的莖、葉可入藥。
