1、石菖蒲可用於治療痰蒙心竅所致的神志不清等症，通常和遠志，茯苓等藥物一起使用，石菖蒲和遠志都可以祛痰清竅，茯苓有利尿去溼痰的作用，合用可以增強療效。
2、石菖蒲還可用於體內溼邪內困所致的胸腹部脹痛，腰痠背痛，頭痛，思睡等症狀，尤其在夏秋季多見。有化溼行氣的作用，通常和藿香一同使用，藿香有化溼解暑的作用。合用可以增強療效。
3、石菖蒲還可用於痢疾嚴重的時候，不能進食者，石菖蒲能夠促進胃液的分泌，減少腸道內的細菌發酵。通常和人蔘，茯苓等藥一同使用。人蔘可以補氣健脾，茯苓可以健脾利尿補中，合用後能夠讓病人開胃進食。
4、石菖蒲還可用於治療真菌引起的各種感染，因爲石菖蒲對皮膚真菌有一定的抑制作用，我們可以用1份的石菖蒲和3份的水泡成石菖蒲水浸劑，外用擦洗皮膚真菌感染部位。
