倆者各有千秋。南方醫科大學，中國人民解放軍第一軍醫大學，廣東省重點建設高水平大學，是教育部卓越醫生教育培養計劃實施高校，廣東省211工程院校，省屬重點大學，由廣東省、國家衛生和計劃生育委員會、教育部共同建設。南京醫科大學，簡稱南醫大，學校位於中國歷史文化名城、六朝古都南京市，是江蘇省屬重點建設大學，教育部卓越醫生教育培養計劃試點高校、江蘇省高層次人才培養計劃333工程培訓基地。
