南方醫科大學學報是核心期刊，《南方醫科大學學報》創刊於1981年，曾用名《第一軍醫大學學報》，是由廣東省教育廳主管，南方醫科大學主辦的綜合性醫藥衛生期刊。《南方醫科大學學報》設有基礎研究、臨牀研究、技術方法、經驗交流、病例報告等欄目。據2019年10月《南方醫科大學學報》官網顯示，《南方醫科大學學報》編輯委員會擁有編委94人。
