沒有加工的紫薯在冰箱內可以保存六個月到八個月不等，如果是加工之後的紫薯，保存時間可能會減少，比如熟的紫薯，在冰箱內只能存放兩三天，時間久了，就容易壞掉。
紫薯的儲藏方法大致有兩種，一種是高溫儲藏，還有一種是低溫儲存。高溫儲藏是將紫薯放入窖後，燒火升溫到35-38℃，並保持2-3天，將紫薯的黑斑病、軟腐病等病菌殺滅。接着將溫度降低到十度左右，進行低溫儲存，這樣效果會很好，只是成本會比較高，操作起來也比較麻煩。
紫薯還可以採用低溫儲藏，在紫薯入窖前一週對薯窖進行消毒，接着在紫薯收穫後及時處理，及時放入地窖中，這樣就可以保存很久的時間。
如果是在家中存放紫薯，一般來說，常溫環境下存放就可以，不需要存放太久，不然容易變質。紫薯也可以放入冰箱中冷藏，只是冷藏時間不宜太久，不然紫薯的水分會大量的流失，這個時候，影響食用口感。
紫薯這種食物也不建議一次性買太多，不然吃不完容易造成浪費。
