世界已知食用菌、藥用菌大約有2000多種。目前已經進行人工栽培或實驗栽培的食用菌種類有200多種，其中包括已經進行大規模栽培的香菇、滑菇、黃傘、平菇、紅平菇、榆黃蘑、姬菇、秀珍菇、鮑魚菇、元蘑、鳳尾菇、杏鮑菇、白靈菇、黑木耳、毛木耳、金耳、銀耳、榆耳、槐耳、蛹蟲草、豬苓、茯苓、竹蓀、猴頭菇、靈芝、雲芝、蜜環菌、假蜜環菌、金針菇、巴西蘑菇、真姬菇、大球蓋菇、灰樹花、楊樹菇、茶薪菇、金福菇、毛頭鬼傘、雙孢蘑菇、四孢蘑菇、大肥菇、草菇、銀絲草菇、大球蓋菇、草地蘑菇、長根菇、虎奶菇、牛舌菌、桑黃、裂褶菌、硫磺菌、繡球菌、竹黃等。還有正在進行半人工栽培試驗研究的松口蘑、羊肚菌、冬蟲夏草、美味牛肝菌、塊菌、鉚釘菇等珍稀食用菌。
