1、民辦大學實行自負盈虧的經營方式，其經費來源是由學院的舉辦方通過各種方式籌集得到。在經費，學費和其他一些相關的管理上也都是按照民辦大學的方式進行管理。公辦大學經費來源於國家。
2、公辦大學的生源好，民辦大學的生源差，是指平均水平。民辦大學的學生，多來自農村家裏，學生就業後更加珍惜機會，做得好的也就比較多。
3、公辦大學容易處分學生，容易掛紅燈。
4、公辦大學是官傣式管理，民辦大學是精細化，甚至軍事化管理，更注重對學生生活學習的管理。
5、公辦大學畢業生獲得的文憑都屬於國民教育系列，分爲全日制，成教，自考，網教。
民辦大學畢業生獲得的文憑分爲三種：第一種是參加大學聯考被錄取的學生，屬於是全日制文憑。第二種是沒經過大學聯考或者大學聯考成績不理想，通過考試後獲得自考文憑。以上兩種文憑也屬於國民教育系列。第三種是既沒參加大學聯考也沒參加自考，由民辦大學自主頒發的文憑，這種屬於非國民教育系列，不能考研考公務員，可用於找工作等用途。
