增施石灰：當地增施石灰，調整土壤酸度，使變成微鹼性，可以減輕發病。廣東經驗，在種菜前撒施消石灰(每畝60-80公斤)，然後進行表土淺翻，定植前在畦面或定植穴內澆2%石灰水，以後隔10-15天再澆2-3次，根腫病很少發生。在根腫病發生以後，用石灰水澆於畦面，也可以減輕危害。
選用無病苗牀和苗牀消毒：選擇無病地育苗，移栽定植時注意淘汰病苗。有病菌污染的苗牀，可用福爾馬林液時行土壤消毒(方法同茄科蔬菜苗期病害相同)。
藥劑防治：五氯硝基苯防治根腫病效果很好，施用方法是栽培前作畦面均勻條施，每畝用藥1.5-3公斤。也可以用75%五氯硝基苯可溼性粉劑700-1，000倍液，移植前每穴澆0.25-0.5公斤藥液。或在田間發現少量病株時用藥液澆灌。
