通常認爲三級結構就有生物活性。比如催化結構域、底物結合結構域等，單獨拆分之後，仍保留一定的生物活性。只有保持完整的蛋白質四級結構，這個蛋白質才能完全的發揮其應有的功能。但是隻有非常巨大的蛋白質纔有四級結構的，比如阿爾法螺旋，或者貝塔摺疊等二級結構的變化，就能夠影響一小部分生物功能，有最近的研究表明酶的某個loop環的改變能夠影響蛋白質是否還有催化功能。
