事業單位與企業單位主要區別如下：
1、主體資格和設立資金的來源不同。事業單位屬於事業法人，企業屬於企業法人。
2、設立主體和設立目的不同。事業單位大都是由國家設立的，如大型國有企業原有的醫院、學校。國家設立事業單位是出於國家管理的需要或社會公共利益的需要。事業單位的工作和服務不以盈利爲目的。例如，學校、公立非盈利醫院。 設立企業的是出資者，國家設立企業時，也是出資者。設立企業的目的是通過經營盈利。
3、管理主體和管理方式不同。對事業單位的管理，主要是由政府主管部門負責。事業單位往往有其隸屬的政府主管部門。政府主管部門主要是依靠行政管理的法規、規章、條例、命令和政策對事業單位進行領導和管理。例如國家對公辦學校的管理。國家對企業的管理是宏觀管理，企業的管理主要由出資者依法建立的包括董事會和總經理在內的管理團隊來負責。
4、企業在其經營過程中，需要向國家繳稅，而事業單位則不需要繳稅。
