醫院編制不屬於機關事業單位，機關單位指黨羣、人大、政府、政協、檢察、法院及其組成部門。公立醫院有經營收入，也承擔着大量的公益服務職能，因此其經費來源，既有地方財政供養部分，也有營收部分，屬於差額供給單位，使用的是差額事業編制。差額事業編制和全額事業編制的性質是一樣的，都是正規的事業編制，專供有生產經營收入的事業單位使用。
