去除雜草稻的主要措施是種子淨化、人工拔除、使用除草劑及深翻壓埋，對於發生數量較少的田塊，可分批拔除，7月底以前一定要拔除乾淨，雜草稻發生較重的田塊，應在上茬作物收穫以後進行10釐米以上的深翻，雜草稻特別嚴重的田塊,建議改種1~2年旱作物,並將田裏的雜草稻及時拔除。
雜草稻的發生,實際上是一種水稻的雜交遺傳返祖現象。基因漂流是雜草稻產生的重要原因。一般由野生稻和栽培稻的粳稻、秈稻經自然或人工干預遠緣雜交演變而來,因基因重組或回覆突變而產生返祖遺傳的野生性狀。由於雜草稻的穀粒休眠性極強,落在地裏的穀粒在第二年,甚至第三年、第四年都能發芽生長。它可以通過鳥類、人爲、機械翻耕帶土四處傳播,免耕稻田有利於雜草稻的生長。
