成熟的木瓜果肉很軟，不易保存，購回後要立即食用。若買後不打算立即食用，建議選擇尚未全黃略帶青色爲優，待回家後襬放1至2天，再以報紙包好放入冰箱冷藏，至多可以保存約4至5天。成熟度在六成以上：最好快吃、如果吃不完就煮糖水或煲骨頭湯放冰箱可放三天.成熟度在五成以下：用保鮮袋套好，放在冰箱也可放三天。此外也可以刨成片或絲放一些糖醋做成酸料保存，慢慢吃。
