水體的顏色主要是由水體的散射、水錶面的反射、水底物質對投射光等的總和對人們的視覺的綜合刺激效應決定的。九寨溝的天空無比潔淨，其大氣中的短波輻射較強，呈現瑞利散射。同時由於水體的選擇性吸收及散射作用，使得潔淨的水體中發射出以短波輻射的光波，呈現出藍色甚至是發紫的現象。而當水體超過一定深度後，其色彩主流來自於水體的散射而顯得藍色變深，對於淺的海子，由於生長着不同顏色的藻類，其水體顏色變化更大，如五花海中的淡黃色、黃褐色藻類，他們選擇性吸收藍光，而反射出紅光和綠光，在反射過程中
