檢察院自偵案件辦案程序如下：
一、受理案件範圍和案件來源
受理案件範圍和案件來源
人民檢察院直接受理刑事案件的範圍，應當按照刑事訴訟法第十三條第二款的規定和最高人民法院、最高人民檢察院、公安部關於案件管轄範圍的分工執行。
二、立案前的審查和立案
人民檢察院對屬於自己管轄的案件的所有控告、檢舉、自首、移送、交辦和自己發現的違法犯罪材料，應當及時進行審查，並分別情況，進行處理。
三、偵查
對於已經決定立案偵查的案件，應當制定偵查計劃，經主管科、處長或檢察長同意後進行。
人民檢察院在偵查工作中除自己直接偵查取證外，必要時也可以委託有關單位調查，然後由檢察人員對有關證據材料加以審覈並簽註意見。
