分離純化的目的是去掉不必要的雜質。純化是將多糖混合物分離爲單一多糖的過程。在進行菌種鑑定時，所用的微生物一般均要求爲純的培養物。得到純培養的過程稱爲分離純化。蛋白的分離純化常見方法，離子交換、分子篩、疏水層析、親和層析等。
