一、私立醫院的會計覈算：新《醫院會計制度》、《基層醫療衛生機構會計制度》沒有明確規定。在會計界，有人認爲應執行《基層醫療衛生機構會計制度》，有人認爲應執行《小企業會計準則》。
二、私立醫院的會計科目設置 ：基層醫療衛生機構會計制度》規定，設置和使用會計科目，在不影響會計處理和編報會計報表的前提下，可以根據實際情況自行設置本制度規定之外的明細科目，不需要的科目可以不設置。
三、私立醫院的性質：根據私立醫院的單位性質和業務範圍，其實質屬於事業單位企業化管理的經濟組織形式，其會計覈算應以《基層醫療衛生機構會計制度》爲基礎，參照《小企業會計準則》的規定進行會計覈算。
