醫院會計科目是對《醫院會計制度》規定的會計覈算對象按其經濟內容或用途進行科學系統的分類，是設置賬戶、處理賬務的依據。醫院應按下列規定運用會計科目：(一)本制度統一規定會計科目的編號，便於編制會計憑證，登記賬簿，查閱賬目，實行會計電算化。醫院不應隨意改變或打亂重編。(二)醫院應按本制度的規定，設置和使用會計科目。明細科目的設置，除本制度已有規定者外，在不違反統一會計覈算要求的前提下，醫院可按根據需要，自行規定。(三)醫院在填制會計憑證、登記賬簿時，應填列會計科目的名稱，或者同時填列會計科目的名稱和編號，不應只填列科目編號，不填列科目名稱。
