1、加熱原理不同
電烤箱的加熱原理：讓電阻絲通電變熱，使電能變成熱能，使得箱體內的溫度提高，繼而對食物進行烘烤至熟，這個過程是由外至裏的。微波爐的加熱原理：通電後，電能變成微波，通過爐內的空氣傳播到食物，然後使得食物內部每一個分子都進行熱運動，從而使得食物變熱繼而成熟，這個過程是由內而外的。
2、烘焙效果不同
烤箱的加熱方式不會破壞食物原有的美味，更可保留食物中所含有的水份和營養成分，烹製的食物外酥內嫩，比較適合東方人的口味。微波爐的主要功能是快速翻熱，在加熱過程中食物本身的水分及營養成分喪失嚴重。所以微波爐烹飪的食物，色香味難以俱全。
3、使用方式不同
雖然二者都是具有食物的加熱功能，但是微波爐更加的注重快熱，也就是說對於許多的上班族來說，爲了使食物快速加熱，那麼選擇微波爐是最好的，如果經常烘焙蛋糕，麪包則選擇電烤箱要更好一些。
