借款合同糾紛的處理方式有：
1、協商。
2、調解。調解有以下三個特徵：第一，調解是在第三方的主持下進行的，這與雙方自行和解有着明顯的不同;第二，主持調解的第三方在調解中只是說服勸導雙方當事人互相諒解.達成調解協議而不是作出裁決，這表明調解和仲裁不同;第三，調解是依據事實和法律、政策，進行合法調解，而不是不分是非，不顧法律與政策在“和稀泥”。
3、仲裁。
4、訴訟。也就是打官司。一般歷時較久，但是費用相對較低。
【法律依據】
根據《民事訴訟法》第一百二十二條規定，當事人起訴到人民法院的民事糾紛，適宜調解的，先行調解，但當事人拒絕調解的除外。
