方法如下：
1、幹泥接種培菌法：最好取水質相同已正常運行的污水系統脫水後的幹污泥作菌種源進行接種培養。一般按曝氣池總溶積百分之一的幹泥量，加適量水搗碎，然後再加適量工業廢水和濃糞便水。按上述的方法培菌，污泥即可很快形成並增加至所需濃度。
2、數級擴大培菌法：根據微生物生長繁殖快的特點，仿照發酵工業中菌種種子罐發酵罐數級擴大培菌工藝，分級擴大培菌。如某工程設計爲三級曝氣池，此時可先在一個池中培菌，在少量接種條件下，在一個曝氣池內培菌，成功後直接擴大至二三級。
3、有毒或難降解工業廢水培菌：有毒或難降解工業廢水，只能先以生活污水培菌，然後再將工業廢水逐步引入，逐步馴化的方式進行。
4、直接引進種菌種培菌：有些特殊水質菌種難於培養，還可利用當地科研力量，利用專業的工業微生物研究所培養菌種後再接種培養，如PVA好氧消化即有專門好氧菌。此法，投資大，週期長，只有特殊情況才用。
