1、蒜種的問題。蒜種的蒜瓣挪動容易受傷而造成爛根；2、保管不善。收種時蒜頭淋雨發黴，有鐵鏽色的根容易爛根；3、水分管理不當。在24小時淹水的情況下，根系會產生無氧呼吸，導致根系受害，嚴重的會死亡。根系初爲黃色，後變黑，病菌侵染導致爛根；4、肥料管理不當。土壤有機質含量不高，土壤板結，導致植株抗逆性下降；5、病害導致。常見的有根腐病、軟腐病，這兩種病害都是導致爛根的主要病菌，尤其在重茬地塊更嚴重。
