金針菇溼水後，建議儘快食用。洗了後不宜長時間保存，中午洗晚上就吃，儘量避免一次大量購買，以致變幹、腐爛、營養價值降低等，造成浪費。金針菇應先裝入食品袋封好，再放人冰箱冷藏保存，因其對保存的溫度、溼度要求較高，不宜長時間保存。新鮮的金針菇如果需要保存，可以將根部剪掉後，在淡鹽水中浸泡10分鐘，瀝乾後再冰箱冷藏保存，這樣可以保存一週左右。金針菇中含有較高的蛋白質，新鮮食用時才能保存良好的清香口味，隔夜後口味變差，另外，金針菇和蔬菜一樣，隔夜還容易滋生其他菌類，引起身體不適。
