加班費屬於勞動者勞動報酬所得的有效組成部分，個人所得稅是按照勞動報酬的總額進行扣取，加班費也是要扣個人所得稅的。【法律依據】《個人所得稅法》第二條規定，下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：(一)工資、薪金所得；(二)勞務報酬所得；(三)稿酬所得；(四)特許權使用費所得；(五)經營所得；(六)利息、股息、紅利所得；(七)財產租賃所得；(八)財產轉讓所得；(九)偶然所得。
