要將培養皿倒置培養是爲了減緩培養皿內培養基水分的蒸發，也爲了方便取用。因爲培養皿蓋子大而底小，如果正着放，取用時容易只拿到蓋子，從而造成平皿內培養基的暴露。而且倒置可以防止在實驗過程中，培養皿內的水汽在皿蓋上冷凝成水珠滴落到培養基上，將雜菌引入培養基，造成污染，從而影響到培養基中微生物的生長。有時候培養的目標是收集細菌的代謝物，然而代謝物有些會易溶於水，而培養皿正放時候蓋上會出現蒸餾水，造成菌落成片，倒置培養皿能方便收集代謝物，以及進行計數或者分離等。
