金針菇不能放冰箱冷凍，金針菇挑出斷損及壓傷的部分，買回時如包裝還是真空狀態，直接放入冰箱冷藏保存。如買回的是散裝金針菇，將其放在紙巾上吸掉多餘水分，再用保鮮膜包裹後放入密實袋密封，冷藏保存。
金針菇清洗方法：抓住金針菇的底部，在水龍頭下衝冼，乾淨之後再切掉底部。
①低溫保鮮法。在溫度爲3℃--5℃、空氣相對溼度爲80％的條件下可保鮮7天--9天。
②曬乾法。將鮮菇置烈日下曝曬。爲加快乾燥速度，可先將鮮菇放在開水中燙3分鐘--5分鐘後再曬乾，然後用塑料袋包裝保存。
③烘乾法。在烘箱或烤房中把金針菇烘乾。此種方法能使金針菇保存30天左右。
