認定企業單位行賄罪的三個問題是:1、企業單位行賄罪的犯罪主體必須是單位;2、企業單位行賄罪在主觀方面只能是直接故意,並且具有爲本單位謀取不正當利益的目的;3、企業單位行賄罪在客觀方面表現爲直接負責的主管人員或直接責任人員根據本單位的意志以單位名義實施的行賄行爲。【法律依據】根據《刑法》第三百九十三條,單位爲謀取不正當利益而行賄,或者違反國家規定,給予國家工作人員以回扣、手續費,情節嚴重的,對單位判處罰金,並對其直接負責的主管人員和其他直接責任人員,處五年以下有期徒刑或者拘役。