肥水對玉竹的產量至關重要，越多越好，特別是鉀肥，但氮肥過多會使其杆葉太嫩，易患病蟲害。下種時，於種苗和覆蓋的稻草層的中間層施人畜糞肥1500至2000公斤每畝（肥料與種苗間隔薄土，以免灼燒種苗，必要時增施復合肥50至150公斤每畝）。次年8至9月於枯苗後，砍除枯苗，扯除雜草，再施以豬牛糞肥1000至1500公斤每畝，並加稻草和新草覆蓋。有條件或土地太瘦時，可於每年清明節苗出5釐米後增施農家肥或複合肥。同時清溝瀝水，防止漚根。
