分辨珍珠龜公母主要是看外表。先從外部輪廓看，雄龜是比較窄而長的，而雌龜是又寬又圓的。其次看它們的腹甲部分，雌龜更加平坦一些。再次看它們的尾巴，雌龜的尾巴更細長，雌龜尾巴是粗短的。最後看泄殖孔，雄龜的泄殖孔離腹甲邊緣要遠一點，形狀是長形的，而雌龜的近似於圓形。
珍珠龜主要通過外表來進行公母分辨。從體型上來看，雄龜的背甲長並且窄，而雌龜的背甲比較圓比較寬。而從腹甲部分來看，由於生理活動的需要，雄龜腹部一般會有凹陷，而雌龜的腹部看上去則十分平坦。從尾巴處觀察，雄龜的尾巴比較短，根部粗壯，而雌龜的尾巴看上去就比較細長。最後，兩者的泄殖孔也是有區別的，雄龜的泄殖孔離腹部的後面的邊緣處比較遠，形狀是長方形的，而雌龜則距離腹甲的邊緣處比較近，形狀近似於圓形。
珍珠龜公母是可以同居的。珍珠龜總體來看性格比較溫和，一般不會去進行主動攻擊。並且如果條件成熟的話，可能會產生自然繁殖的現象。只是在混養的過程中，注意養殖的密度，如果密度比較大的話，儘量需要隔離一下，因爲難免會產生領地意識，一些個頭比較大的就容易去欺負個頭比較小的。因此公母是可以同居的，只是需要注意密度問題。
