根據氧化還原反應中最終電子受體的不同，分解代謝可分成發酵和呼吸兩類。呼吸根據微生物對氧的需求又可以分成好氧呼吸、兼性厭氧呼吸、微好氧呼吸、耐氧呼吸、厭氧呼吸5種類型。
1、好氧呼吸，是指需要氧氣才能生活的微生物的呼吸類型；
2、兼性厭氧呼吸，是指有氧、無氧皆可生活的微生物的呼吸類型；
3、微好氧呼吸，是指大多數進行無氧呼吸，少數進行有氧呼吸的微生物的呼吸類型；
4、耐氧呼吸，是指進行無氧呼吸，但是可以耐受微量氧氣的微生物的呼吸類型；
5、厭氧呼吸，是指只能進行無氧呼吸，環境必須無氧的微生物的呼吸類型。
