一、經營規模不同：
個人獨資企業必須有固定的生產經營場所和合法的企業名稱，屬於一個小公司；個體工商戶可以沒有企業名稱，也可以沒有固定的經營場所。
二、分支機構的設立：
個人獨資企業可以設立分支機構；個體工商戶根據規定是不可以設立分支機構的。
三、財務制度和稅收政策不同：
個人獨資企業必須建立財務制度，進行會計覈算；個體工商戶在是否建立會計制度上存在許多爭議，如稅務部門不作硬性要求，也可以不進行會計覈算。
四、適用法律不同
個人獨資企業依照《個人獨資企業法》設立；個體工商戶按照《民法》和《城鎮個體工商戶管理暫行條例》等規定設立。
五、承擔責任不同
個人獨資企業投資人以其個人財產對企業債務承擔無限責任；而個體工商戶的債務如屬個人經營的，以個人財產承擔，如屬家庭經營的，以家庭財產承擔
【法律依據】
根據《獨資企業法》第31條：個人獨資企業財產不足以清償債務的，投資人應當以其個人的其他財產予以清償。
