異丙醇有毒。
1、毒性分級：微毒類。
2、急性毒性：口服-大鼠LD50:5840毫克/公斤；口服-小鼠LC50:3600毫克/公斤，家兔經皮LD50爲16.4ml/kg。
4、高濃度蒸氣具有明顯麻醉作用，對眼、呼吸道的黏膜有刺激作用，能損傷視網膜及視神經。
生理作用與乙醇相似，在體內幾乎無蓄積，毒性、麻醉性以及對上呼吸道黏膜的刺激都比乙醇強，但不及丙醇。接觸高濃度蒸氣出現頭痛、倦睡以及眼、鼻、喉刺激症狀。食入或吸入大量的蒸汽可引起面紅、頭疼、精神抑鬱、噁心、昏迷等。
2017年10月27日，世界衛生組織國際癌症研究機構公佈的致癌物清單初步整理參考，使用強酸生產異丙醇在一類致癌物清單中、異丙醇在3類致癌物清單中。
防護措施：
空氣中最高容許濃度980mg/m3，工作場所最高容許濃度爲1020mg/m3，嗅覺閾濃度1.1mg/m3，操作人員應戴防毒面具，濃度高時應戴氣密式防護眼鏡。
