1、乙酰CoA進入三羧酸循環：乙酰CoA具有硫酯鍵，乙酰基有足夠能量與草酰乙酸的羧基進行醛醇型縮合；
2、異檸檬酸形成：檸檬酸的叔醇基不易氧化，轉變成異檸檬酸而使叔醇變成仲醇，就易於氧化，此反應由順烏頭酸酶催化；
3、第一次氧化脫羧：此反應是三羧酸循環中的限速步驟，ADP是異檸檬酸脫氫酶的激活劑，而NADH是此酶的抑制劑；
4、第二次氧化脫羧：阿爾法酮戊二酸脫氫酶複合體受ATP、GTP、NADH和琥珀酰CoA抑制；
5、底物磷酸化生成ATP：在琥珀酸硫激酶的作用下，琥珀酰CoA的硫酯鍵水解，釋放的自由能用於合成gtp；
6、琥珀酸脫氫：琥珀酸脫氫酶催化琥珀酸氧化成爲延胡索酸；
7、延胡索酸的水化：延胡索酸酶僅對延胡索酸的反式雙鍵起作用，而對順丁烯二酸則無催化作用
8、草酰乙酸再生：在蘋果酸脫氫酶作用下，蘋果酸仲醇基脫氫氧化成羰基，生成草酰乙酸。
