獨頭蒜的繁殖是依靠大蒜的鱗芽而成，大蒜的鱗莖靠近蒜薹的1-2層(多瓣蒜爲1-6層)葉鞘間產生的鱗腋芽肥大而形成的。鱗芽即是大蒜的營養物質的儲藏器官，也是大蒜的無性繁殖器官。
鱗芽的分化與肥大以同化物質的輸入貯存爲基礎，並以溫度(15℃-20℃）和日照(13h以上)爲必要環境條件。而大蒜花薹的形成又以低溫爲前提條件，萌動的蒜瓣在0℃-4℃下經30-40天可完成春化，分化花芽，並在溫暖過長日照下抽薹。植株生長期間既未滿足抽薹對低溫的需要，也缺乏足夠的營養物質供給鱗芽分化，其結果不僅不抽薹，也不能形成側芽，而在長日照和溫暖的氣候條件來臨時，外層葉鞘中的營養內移，貯於頂芽的最內層鱗片之中，使頂芽的內層鱗片變得特別肥厚，從而形成獨頭蒜，如此就繁殖了獨頭蒜。
