四腳蛇和壁虎的區別有分佈區域不同、形態特徵不同、科目不同。
1、分佈區域不同：壁虎主要產於我國西南及長江流域以南諸地區；也分佈到日本和朝鮮；四腳蛇主要分佈在我國福建、廣東、廣西、江蘇、浙江等地區。
2、形態特徵不同：壁虎是壁虎吻斜扁，吻長約爲眼徑的2倍。吻鱗長方形，上緣與一對較大的鼻間鱗及其中間一片小形鱗片相聯。頦鱗五角形，前寬後窄。後頦鱗3對，外側一對最小。耳孔小，卵圓形，內陷體背自額、頂、顳、枕部至尾基被以粒鱗；四腳蛇吻鈍圓，吻長爲眼徑的1.5倍。鼻孔在鼻鱗的中央。鼻鱗、吻鱗、頭部鱗大小不等。有鼓膜，鼓膜處覆有小鱗。眼瞼發達，能動，瞳孔圓形。背鱗及體側的鱗較小。背中央有鬣鱗，愈向後愈小，至尾部消失。其兩外側各有1行棱鱗。全體披有鱗片。
3、科目不同：壁虎屬於蜥蜴目壁虎科；四腳蛇屬於有鱗目蜥蜴科。
