1、生活習慣不同：壁虎在溫暖的叢林、沙漠都有分佈，溫度低於11攝氏度很難存活。馬蛇子又稱蜥蜴，生活於地下、地表或高大的植被中。
2、食性不同：壁虎在燈光照射的牆壁上、屋檐下或電杆上，捕食蚊、蠅、飛蛾、蜘蛛等。蜥蜴以昆蟲、蚯蚓、蝸牛，甚至老鼠爲食，也有以仙人掌或海藻爲主食。
3、外形不同：壁虎體背腹扁平，身上有粒鱗或雜有疣鱗，指、趾端擴展，下方形成皮膚褶襞，密佈腺毛，有粘附能力，可在牆壁、天花板或光滑的平面上迅速爬行。蜥蜴身體多細長，具長尾，多具4肢，除鼻孔、口、眼及泄殖腔開口外，體表覆以鱗片，一對眼睛和一對耳孔，如無外耳孔，則鼓膜位於表面，有些種於頭和體鱗下真皮內有骨鱗，表面覆以一層角蛋白。
