自然條件下錦鯉和普通鯽魚是不可以雜交的。動物分類從大到小爲門，綱，目，科，屬，種，最小的就是種，雖然錦鯉和普通鯽魚都屬於鯉科，有着相似或相近的特徵，但它們分屬於不同的種，也就是意味着它們的遺傳物質是不一樣的，即有着不同的染色體和基因，染色體不同，在自然條件下是根本無法完成受精後的染色體重組、配對乃至細胞的分裂，因此就不會有下一代產生，所以錦鯉和普通鯽魚是不可以雜交的。
