因爲豆漿是一種蛋白質飲品，本身就容易變質，最好新鮮飲用，特別是在家有條件用豆漿機打豆漿時，最好是現打現喝，如果實在喝不完，可以裝起來放冰箱裏，但最多存放四到六小時。不少上班族和學生習慣將豆漿放入保溫瓶或是杯子裏儲藏，等上幾個小時後再飲用，這種方式是不提倡的，因爲在溫度適宜的條件下，以豆漿作爲養料，瓶內細菌會大量繁殖，因此無論哪種容器保存，都不建議放太久。其次，不要把豆漿跟水垢混在一起，因爲豆漿裏的皁毒素會溶解暖瓶裏的水垢，喝了會危害人體健康。
